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陳根:RAS致癌基因突變頻率,僅為此前一半

 陳根談科技 2021-11-06

文|陳根

癌癥是世界首要死因之一,其特征在于基因組中的突變或其他改變導(dǎo)致細(xì)胞生長(zhǎng)不受控制。腫瘤可出現(xiàn)數(shù)百至數(shù)千種突變,但只有少數(shù)幾個(gè)基因?qū)ζ渲铝瞿芰χ陵P(guān)重要,比如TP53、PIK3CA、KMT2C、ARID1A、KMT2D、LRP1B、PTEN、RB1、FAT4、KRAS。

10個(gè)基因每個(gè)的突變都能導(dǎo)致20多種不同類型的癌癥,其中最厲害的就是TP53基因,其突變導(dǎo)致的癌癥超過50種。近日,科學(xué)家們開發(fā)了一種新方法,重新統(tǒng)計(jì)分析了泛癌種中致癌突變基因的頻率,結(jié)果與此前的認(rèn)知差距較大。

新方法利用的系統(tǒng)名為ROSETTA(Reclassification Of Sequencing and Epidemiological Tumor Type Annotations),其能夠得到各個(gè)癌種在所有癌癥中的占比。最常見的五種癌癥是乳腺癌、前列腺癌、結(jié)直腸癌、肺腺癌和惡性黑色素瘤,加起來占50%以上;前十名合計(jì)占比達(dá)到68.7%。

  在這些癌癥中,最常見的致癌突變基因是TP53,35%的新發(fā)癌癥有它;而被認(rèn)為最常突變的原癌基因KRAS,只有11%;排名靠前的還有BRAF,占8%。前十名里KMT2C、KMT2D、ARID1A是表觀遺傳修飾相關(guān)基因,可見癌癥中表觀遺傳失調(diào)十分常見。

既往的研究普遍顯示,RAS致癌基因在所有人類癌癥中出現(xiàn)的頻率大約在30%-33%,但在新的研究中,這個(gè)數(shù)字實(shí)際上只有15%,僅為此前的一半。

此外,大部分突變基因在兩者之間的差距不到5%。腺癌比鱗癌高的僅有KRAS和APC突變頻率差距較大(14%vs1%,13%vs5%);鱗癌比腺癌高的主要有LRP1B(23%vs10%),KMT2D(16%vs7%),F(xiàn)AT1(15%vs5%),CDKN2A(12%vs2%),NOTCH1(10%vs3%)和NEF2L2(10%vs1%)。

  科學(xué)家們認(rèn)為,出現(xiàn)這種現(xiàn)象的原因是許多致癌突變與癌癥類型有關(guān),很多癌種發(fā)病率較低,因此在該癌種中致癌基因出現(xiàn)頻率再高,放到泛癌種中也并不是舉足輕重的地位了。

常見突變基因的鑒定對(duì)于藥物開發(fā)起著重要作用,未來,該研究或可為相關(guān)藥物研發(fā)提供一定思路。

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