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中國(guó)造出的人工生命,或許能幫你續(xù)命

 育則維善余言 2018-08-03

今天,合成生物學(xué)界出了件事。


這事兒呢,說(shuō)也大不大,也就是搞出了一種新的酵母。



這事兒,說(shuō)小也不小,酵母的16條染色體,被他們弄成了1條。


并且,人家還活得好好的!



8月2日,《自然》(Nature)雜志在線(xiàn)發(fā)表了一篇論文,中國(guó)科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心/植物生理生態(tài)研究所覃重軍研究團(tuán)隊(duì)與合作者在國(guó)際上首次人工創(chuàng)建了單條染色體的真核細(xì)胞,中國(guó)科學(xué)家獨(dú)立創(chuàng)造了全新的自然界不存在的生命。

 

1

都是微生物,差別咋那么大?


自然界的生命體分為真核生物和原核生物兩種。真核生物通常含有線(xiàn)型結(jié)構(gòu)的多條染色體,比如人類(lèi)、動(dòng)植物、真菌、酵母菌;而原核生物通常只有一條環(huán)型的染色體,最典型的就是各種細(xì)菌。


酵母和細(xì)菌都是人類(lèi)熟悉的微生物,為何差別卻這么大?


這讓覃重軍產(chǎn)生了一個(gè)“瘋狂的”想法——他要試圖去打破真核生物和原核生物的界限。



“單倍體酵母有16條染色體,我就想,能不能把它們簡(jiǎn)化一下,把它變成像細(xì)菌一樣,用一條染色體來(lái)裝載所有的遺傳物質(zhì),同時(shí)完成正常的細(xì)胞功能呢?”

 

2

“壓縮”生命


有了這個(gè)大膽的設(shè)想之后,覃重軍與副研究員薛小莉用工程化精準(zhǔn)設(shè)計(jì)的方法,定制了人造單染色體酵母的指導(dǎo)原則,以及理性分析、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、工程化推進(jìn)的總體方案。并指導(dǎo)學(xué)生從2013年起,嘗試并發(fā)展高效的染色體操作方法。


研究人員歷經(jīng)4年時(shí)間,通過(guò)15輪的染色體融合,最終成功創(chuàng)建了只有一條線(xiàn)型染色體的釀酒酵母菌株。


經(jīng)過(guò)代謝、生理、繁殖功能及染色體三維結(jié)構(gòu)的鑒定,覃重軍等人發(fā)現(xiàn),雖然人工酵母的單條線(xiàn)型染色體三維結(jié)構(gòu)發(fā)生了巨大變化,但這種酵母與天然酵母一樣具有正常的細(xì)胞功能。


如果你看不懂上面的,就看下面的圖吧:


人造單染色體酵母與天然酵母細(xì)胞對(duì)比圖,兩者形態(tài)差不多,但染色體的三維結(jié)構(gòu)有巨大改變


小編有意中得知,覃重軍能成功把16條染色體合并成1條的關(guān)鍵因素之一,是因?yàn)樗麄儼阉腥旧w末端的重復(fù)序列都剔除出去了。


“基因組為什么一定要那么大,把冗余的信息減掉會(huì)怎樣?這些生命的‘冗余信息’,刪掉它們,或許能給合成生物學(xué)家一個(gè)機(jī)會(huì),能夠?qū)⑻烊粡?fù)雜的酵母染色體通過(guò)人工改造,以全新的簡(jiǎn)化形式表現(xiàn)出來(lái)?!?/span>



這正是覃重軍最大膽的地方。在很多科學(xué)家眼中,生命的遺傳物質(zhì)里盡管有許多重復(fù)信息,但既然大自然的進(jìn)化把它們保留下來(lái)了,就肯定有它存在的道理。


可是在合成生物學(xué)家的實(shí)驗(yàn)室里,大量冗余信息的存在,卻常常讓他們陷入泥潭。


美國(guó)科學(xué)院院士Jef Boeke是人工合成酵母基因組國(guó)際計(jì)劃的負(fù)責(zé)人,在聽(tīng)聞覃重軍的成果后,他驚呼:“你的膽子太大了!我們都不敢把這些序列去掉?!?/span>



實(shí)際上,在這期《自然》雜志同期在線(xiàn)發(fā)表的論文中,Boeke團(tuán)隊(duì)也報(bào)告了一項(xiàng)成果,他們把酵母的16條染色體,壓縮到了2條。


nature網(wǎng)站首頁(yè)對(duì)兩篇論文的報(bào)道截圖

 

3

有什么事,比100篇《nature》還重要?


覃重軍的酵母不但活了,還活得挺好。


自然科研中國(guó)區(qū)總監(jiān)Paul Evans:覃博士和他的團(tuán)隊(duì)編輯了釀酒酵母的基因組,創(chuàng)造了將幾乎所有遺傳信息融合進(jìn)單個(gè)染色體的酵母菌株。盡管融合顯著改變了三維染色體結(jié)構(gòu),但經(jīng)證實(shí),改造后的酵母細(xì)胞出乎意料地穩(wěn)健,在不同的培養(yǎng)條件下,沒(méi)有表現(xiàn)出重大的生長(zhǎng)缺陷。


因?yàn)榧葲](méi)有引入外源基因,也沒(méi)有刪除必備的遺傳物質(zhì),覃重軍認(rèn)為,這種人工合成的酵母是非常安全的,“既可以做研究又可以吃,基礎(chǔ)研究和應(yīng)用的前景都很廣闊”。(看到這里小編好像有點(diǎn)餓了……)


覃重軍在觀察單染色體酵母的生長(zhǎng)情況  楊正行攝


研究結(jié)果出來(lái)后,多名國(guó)際同行都向覃重軍發(fā)出了合作邀請(qǐng),希望能盡快將這種酵母進(jìn)行產(chǎn)業(yè)化??神剀娪X(jué)得,他身上還肩負(fù)著更重要的使命,他想用這種酵母,開(kāi)展人類(lèi)疾病的研究。


位于染色體兩頭的端粒是他的下一個(gè)目標(biāo)。科學(xué)家已經(jīng)知道,人類(lèi)的衰老、基因突變、腫瘤形成等都與端粒的縮短密不可分,當(dāng)端粒變得不能再短時(shí),細(xì)胞就會(huì)死亡。關(guān)于端粒的研究獲得了2009年的諾貝爾獎(jiǎng)。


就是他們?nèi)齻€(gè)哦??


釀酒酵母是研究染色體異常的重要模型,1/3基因與人類(lèi)基因同源,但天然酵母具有32個(gè)端粒,研究起來(lái)困難重重。相比之下,人造單染色體酵母只有2個(gè)端粒,能夠?yàn)檠芯咳祟?lèi)端粒功能及細(xì)胞衰老提供一個(gè)很好的模型。


覃重軍:我們靠想象力打開(kāi)一扇扇大門(mén),靠理性選擇其中正確的一扇。如果我們的酵母能夠?yàn)槿祟?lèi)健康作出一些貢獻(xiàn),那比我發(fā)100篇《Nature》還要有價(jià)值。



4

一邊遛彎一邊發(fā)Nature


覃重軍說(shuō)自己是個(gè)“懶人”,最近5年來(lái),他平均每年的論文還不到1篇;他也不怎么去積極申請(qǐng)經(jīng)費(fèi),每天要么在單位院子里散步,要么就是關(guān)在辦公室里,琢磨事兒。


他開(kāi)玩笑說(shuō),像他這樣的人在別的地方,估計(jì)早就被開(kāi)除了。


但是,他所工作的中科院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心/植物生理生態(tài)研究所非但沒(méi)開(kāi)除他,還讓他當(dāng)了中科院合成生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任;中科院非但沒(méi)冷落他,還讓他承擔(dān)了院先導(dǎo)專(zhuān)項(xiàng)的課題。


這都是因?yàn)樗聊サ氖?,從?lái)沒(méi)有人做過(guò)。


覃重軍與他的兩千多頁(yè)實(shí)驗(yàn)手稿 楊正行攝


覃重軍的實(shí)驗(yàn)手稿及經(jīng)常閱讀的書(shū)籍  楊正行攝


單染色體酵母的誕生,被認(rèn)為是繼上世紀(jì)60年代中國(guó)人工合成牛胰島素和tRNA之后,中國(guó)在合成生物學(xué)領(lǐng)域的又一個(gè)重要貢獻(xiàn)。


它也更像是一個(gè)新的范例。覃重軍和他的同事,將經(jīng)典分子生物學(xué)的“假設(shè)驅(qū)動(dòng)”與合成生物學(xué)的“工程化研究模式”相結(jié)合,為學(xué)科的發(fā)展提供了新的思路。


Doi:https:///10.1038/s41586-018-0382-x

 

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