|
一母生九子,在育種者眼中,如果用經(jīng)驗(yàn)育種,那這九子是不同的,如果用育種值育種,那這九子就是相同的。為什么? 對育種者而言,一母生九子,九子各不同,九子又相同。 我們認(rèn)為這是一個育種選擇技術(shù)的更新方向: 差值選擇法 > 配合力分析法 > BLUP育種值分析方法 分析對比3種育種方法,看區(qū)別找差距。
一、差值選擇育種法 對于同一基因型所組成的群體,在大量測定的情況下,其表型值的平均等于其基因型值。對于多種基因型所組成的群體,其表型值的平均等于平均的基因型值。傳統(tǒng)的經(jīng)驗(yàn)育種以差值選擇 性狀間的遺傳相關(guān)為選擇技術(shù),由于觀察和選擇僅能基于表型,因此,是建立在基因型值差值基礎(chǔ)上的育種選擇。 二、配合力育種
此處僅考慮一般配合力(GCA),由于配合力模型,沒有分離地點(diǎn),年度等固定效應(yīng),因此一般配合力只能說是對應(yīng)基因加性效應(yīng)的估計(jì)值,其并不等于基因的加性效應(yīng)(育種值)。 三、育種值育種 依照數(shù)量遺傳學(xué)的效應(yīng)模型: 表現(xiàn)型值 = 基因型值 環(huán)境效應(yīng) 隨機(jī)誤差 P = G E e 基因型值 = 加性效應(yīng) 顯性效應(yīng) 上位性效應(yīng) G = A D I 由于親代傳遞給子代的是基因,不是基因型,等位基因間的顯性互作,非等位基因間的上位性互作跟基因型有關(guān)?;虻募有孕?yīng)才能遺傳給子代,互作效應(yīng),上位性效應(yīng)都不能,基因的加性效應(yīng)決定了子代跟親代表型的相似,因此育種選擇應(yīng)依據(jù)基因的加性效應(yīng)進(jìn)行,也就是A。 在父母一致的情況下,一母生九子,九子各不同,其不同是因?yàn)榕渥拥莫?dú)立分配自由組合,九子有不同的基因型。九子獲得的親代基因加性效應(yīng)相同,因?yàn)槎紒碜酝粋€母同一個父。親本傳遞育種值的一半給子代。對育種者而言,一母生九子,九子各不同,九子又相同。 我們不去探討育種值這樣的說法是否完全符合遺傳學(xué)實(shí)證,讀者可以自行思考,現(xiàn)在考慮BLUP育種值分析方法的育種實(shí)用性。 BLUP育種值分析結(jié)果,是對系譜中的每一個祖先都給出一個育種值的,即便這個祖先僅存在系譜中,實(shí)際試驗(yàn)中不存在。 假定系譜中有一個祖先K,其在計(jì)算系譜中不止出現(xiàn)1次,多次出現(xiàn),但是最終得到的K的育種值只有1個值,按照基因的獨(dú)立分配規(guī)律,K在遺傳上的貢獻(xiàn)很可能每次都不同,但是計(jì)算得到的K僅有1個育種值。也就是說,盡管K以不同的遺傳貢獻(xiàn)出現(xiàn)多次,但是就認(rèn)為它的遺傳貢獻(xiàn)是一樣的,而這就是K的基因加性效應(yīng)。K傳遞給后代的可能是顯性基因可能是隱性基因,不重要。 有人會想,一母生九子,怎么可能最差的那個子代和最好的那個子代,來自親代的基因加性效應(yīng)相同,如果想不通,可以試想,有兩個母本跟同一個父本雜交,各生了九子,排序后,基因加性效應(yīng)高的母本的九子,每一個都好于效應(yīng)低的母本的九子。 數(shù)量遺傳學(xué)的效應(yīng)模型本身就是一個描述遺傳規(guī)律的數(shù)學(xué)模型,本身就會存在一些理想化的假定。 看大名鼎鼎的BLUP動物模型,
動物模型在做效應(yīng)分解的時候,將試驗(yàn)中的1個觀測值,剖分為了若干個固定效應(yīng) 育種值 誤差,這若干個固定效應(yīng)在植物育種中就包括,年度效應(yīng),地點(diǎn)效應(yīng)等,模型中就沒有出現(xiàn)顯性效應(yīng)D,上位性效應(yīng)I. 不是說顯性效應(yīng)D,上位性效應(yīng)I不重要,從模型的角度可以假定試驗(yàn)不存在這兩種效應(yīng),也可以考慮成,即便存在這兩種效應(yīng),對結(jié)果影響不大或者沒什么影響。BLUP的育種值分析方法推導(dǎo)證明時,出現(xiàn)了cov(y,a)=ZG ,cov是covariance 協(xié)方差,cov(y,a)是觀測值y和隨機(jī)效應(yīng)間的協(xié)方差矩陣。Z是關(guān)聯(lián)矩陣,非0即1,G的含義要根據(jù)模型來確認(rèn),比如動物育種的動物模型:
, 再回到這句話:對育種者而言,一母生九子,九子各不同,九子又相同。 九子各不同(基因型),九子又相同(親代育種值)。 從上面的分析,能看到系譜對育種值計(jì)算的重要性,也能看到,育種值計(jì)算和配合力的不同,育種本質(zhì)上選擇的是基因,而從基因的角度考慮育種選擇問題,對應(yīng)的就是基因的加性效應(yīng)(育種值)。 嘗試在配合力計(jì)算中也引入系譜,引入親緣關(guān)系,于是配合力模型 加上相應(yīng)的遺傳相關(guān)矩陣,拓展到線性混合模型形式,就是Rex.Bernardo的:
Rex.Bernardo在1994年發(fā)表一篇文章,Prediction of Maize Single-Cross Performance Using RFLPs and Information from Related Hybrids(利用RFLP和來自相關(guān)雜交種的信息預(yù)測玉米單交性能),將Henderson 的BLUP MME理論及分析方法應(yīng)用于玉米育種。但是從育種實(shí)用性的角度,還是建議采用植物育種值模型(本質(zhì)上還是動物模型),尤其在分子育種快速發(fā)展的今天,即便采用配合力,也要去學(xué)習(xí)了解育種值了。還是那句話,使用育種值不是否定配合力是對配合力育種的提升。 有讀者會注意到動物育種學(xué)介紹BLUP的時候,以個體育種值的方式出現(xiàn),植物育種,經(jīng)常是一個一個的株系,感覺跟動物不同。 一母生九子,在育種者眼中,如果用經(jīng)驗(yàn)育種,那這九子是不同的,如果用育種值育種,那這九子就是相同的。兩個玉米株行雜交,收獲9個穗子,就是九子了,種下去是新的9個株行,用數(shù)量遺傳學(xué)的思想,用育種值去看,動物和植物育種就沒有不同。 參考文獻(xiàn):2019.1《種子科技》刊出了博思公司文章《關(guān)于用育種值提升一般配合力分析水平的研究》。 更多信息,參看: 《育種實(shí)用統(tǒng)計(jì)學(xué)》介紹: |
|
|