朱元璋與馬皇后的合葬陵寢之所以被稱為孝陵，有兩種說法，一種說法是朱元璋奉行孝治天下，另一種說法是馬皇后的謚號為“孝慈”。

明孝陵位于紫金山南麓，始建于洪武九年，由中軍都督府僉事李新主持營建。

漢朝時，風水先生認為此山“（金陵）王氣所鐘”，因此，紫金山又被稱為鐘山。

帝師劉伯溫諳熟風水堪輿之術(shù)，朱元璋帶著劉伯溫、徐達、湯和一起勘察，“左青龍，右白虎，前朱雀，后玄武”，朱元璋選定了這塊風水寶地。

陵區(qū)內(nèi)南朝七十多所寺院被悉數(shù)遷出。

孫權(quán)墓位于獨龍阜南邊的梅花山，李新請旨遷出，朱元璋沒有同意，因此僅將石麒麟遷走。

以前，帝王陵寢前的神道都是筆直地。

為了保全孫權(quán)墓，明孝陵前的神道隨地形變化設計成曲折幽深的S形，整個陵區(qū)按中軸對稱的形式設計，呈前朝后寢的三進院落布局，具服殿、享殿、方城、明樓、寶城等建筑物坐落于南北中軸線上。

第一進院落是祭祀準備區(qū)，以具服殿為中心。

第二進院落是祭祀?yún)^(qū)，以享殿為中心。

第三進院落是陵寢區(qū)，前面有方城、明樓，后面是地宮，上面的圓形大土丘，圍繞在周圍的磚墻稱為寶城。

洪武十五年，孝陵基本建成，當年馬皇后去世，安葬于此。

此后，明清帝王的陵墓沿用了明孝陵的這種布局，如明十三陵、清東陵、清西陵。明孝陵被稱為“明清皇家第一陵”。

李新因設計、督建之功被封為崇山侯。