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新科學(xué)家報(bào)道,首次在尼安德特人基因組里發(fā)現(xiàn)的古代病毒DNA現(xiàn)在首次被發(fā)現(xiàn)在現(xiàn)代人類身上——盡管這種病毒是否會引起疾病目前仍不清楚。日前,來自英國牛津大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員在《當(dāng)代生物學(xué)》雜志上報(bào)告了一項(xiàng)驚人發(fā)現(xiàn):一種改變了尼安德特人(Neanderthal)和丹尼索瓦人(Denisovan)的古老逆轉(zhuǎn)錄病毒,現(xiàn)在被發(fā)現(xiàn)同樣也在現(xiàn)代人類——某些癌癥患者的 DNA 中留下了一些改變。自那時(shí)起,遺傳學(xué)家就密切關(guān)注這些古代DNA序列試圖獲得石器時(shí)代生活的新見解。
多年來,科學(xué)家們已經(jīng)知道一些病毒不僅可以影響動物(和人類)的普通生物學(xué),還可以進(jìn)入到它們的基因組中引起 DNA 鏈改變。這些改變隨后可以傳遞給后代。然而到目前為止,還沒有發(fā)現(xiàn)有這樣的 DNA 鏈引起了人類疾病。 2012 年 6 月,另一個(gè)研究小組發(fā)現(xiàn)存在于尼安德特人和丹尼索瓦人 DNA 中的一些改變是由于一種古老的逆轉(zhuǎn)錄病毒所導(dǎo)致。這種病毒在基因組的“垃圾” DNA 序列中留下了其存在的證據(jù),但其似乎并沒有做任何事情,因?yàn)樗鼈儾话圃斓鞍踪|(zhì)的基因指令。該研究小組找到了 14 個(gè)獨(dú)特的病毒證據(jù)實(shí)例。帶著好奇,該研究小組隨后查看了在現(xiàn)代人類 DNA 中是否存在這14種病毒證據(jù)中任何的一個(gè)。他們粗略的檢測沒有找到任何的匹配——換句話說,現(xiàn)代人類似乎并不與他們已滅絕的近親共享內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒DNA。在這項(xiàng)新研究中,英國研究小組更深入地關(guān)注并完成了這一檢測,由此發(fā)現(xiàn)了7個(gè)匹配,但它們僅存在于癌癥患者中。更具體地說,他們從 67 個(gè)罹患某些癌癥類型的人們那里獲得了 DNA 樣本。通過研究這些樣本,研究人員發(fā)現(xiàn)每一個(gè)癌癥患者都有7個(gè)病毒序列與去年在尼安德特人和丹尼索瓦人 DNA 中發(fā)現(xiàn)的相匹配,但只有一個(gè)基因組攜帶這些DNA序列,因此確定它的位置非常耗時(shí)間。
這些研究結(jié)果表明,垃圾序列中保存有遠(yuǎn)古病毒信息的人們與患癌傾向之間存在關(guān)聯(lián)。研究人員認(rèn)為,鑒于他們的研究發(fā)現(xiàn),有可能去年在尼安德特人和丹尼索瓦人 DNA 中發(fā)現(xiàn)的其他7種逆轉(zhuǎn)錄病毒,也存在于當(dāng)前活著的其他人的基因組中。這有可能意味著,這些人具有更高的機(jī)率罹患其他未知的醫(yī)學(xué)問題,而這將需要開展更多的研究。該研究小組也表示有可能需要投入大量的時(shí)間來檢測飽受許多疾病折磨的人群他們的基因組。“他們在所謂的人類參考基因組里尋找這些逆轉(zhuǎn)錄基因,”貝爾肖說道。這是利用來自很多個(gè)體的信息積累而成的,但基因組里每個(gè)特定位置所包含的信息只來自一個(gè)個(gè)體。意外的,倫茲研究小組所研究的參考基因組區(qū)域恰好來自于那些缺少內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒基因序列的個(gè)體。 這項(xiàng)最新的研究非常重要,馬基奧基尼斯說道,因?yàn)樗鼜?qiáng)調(diào)了現(xiàn)代人類基因組里的非編碼部分每個(gè)人各不相同?!斑@項(xiàng)結(jié)果顯示我們能夠找到與尼安德特人或者丹尼索瓦人共享基因組的個(gè)體。”這顯示了了解單獨(dú)個(gè)體是否存在或者缺少某個(gè)特定序列,而非僅憑猜測的重要性,英國倫敦MRC國立醫(yī)學(xué)研究所的喬納森·斯托耶(Jonathan Stoye)這樣說道。對于確定內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒與疾病之間是否存在真正的聯(lián)系,這些正確分析的數(shù)據(jù)必不可少。貝爾肖和馬基奧基尼斯的研究小組目前正在探索這種逆轉(zhuǎn)錄病毒DNA在現(xiàn)代人口中的存在究竟有多廣泛,以及這種病毒本身是否是活躍的?!霸诮酉聛淼?年內(nèi),我們應(yīng)該能夠確定這些古代病毒在現(xiàn)代人類疾病中是否起著一定的作用。”貝爾肖說道?!拔覀冎肋@些病毒會在其它動物身上引發(fā)疾病,包括老鼠,”貝爾肖說道。還有證據(jù)表明,從患有運(yùn)動神經(jīng)元病的病人身上抽取的組織中這些病毒仍處于活躍狀態(tài)?!暗壳吧形疵鞔_的證實(shí)這些病毒在人類身上會引發(fā)疾病?!?/p> 原文檢索:Emanuele Marchi, Alex Kanapin, Matthew Byott, Gkikas Magiorkinis, and Robert Belshaw. Neanderthal and Denisovan retroviruses in modern humans. Current Biology, 18 November 2013; doi:10.1016/j.cub.2013.10.028 |
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