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▎藥明康德內(nèi)容團(tuán)隊編輯 在對人類基因組進(jìn)行解讀后，科學(xué)家們曾大失所望。自詡為“萬物之靈”的我們，基因組中居然只有區(qū)區(qū)兩萬多條基因，沒比不起眼的果蠅多多少。在編碼DNA的序列之外，更有約98%的基因組意義不明，看似沒有任何作用。為此，也有人說我們的基因組里都是“垃圾DNA”。然而隨著生命科學(xué)的不斷發(fā)展，人們也逐漸意識到自己曾經(jīng)的目光短淺。即便基因組中的不少序列并不編碼蛋白質(zhì)，但相應(yīng)產(chǎn)生的RNA卻有著自己不可或缺的功能。先前，已經(jīng)有很多研究指出非編碼RNA參與了大量基因的調(diào)控，控制基因的開關(guān)，締造了各式各樣的細(xì)胞。而頂尖學(xué)術(shù)期刊《細(xì)胞》雜志最近發(fā)表的一篇封面論文，則揭示了RNA的另一項(xiàng)重要功能——在細(xì)胞核內(nèi)劃分不同空間，影響DNA之間的接觸，異染色質(zhì)的組裝，以及基因的調(diào)控。
Image credit: Inna-Marie Strazhnik/Caltech
這項(xiàng)研究來自加州理工學(xué)院的Mitchell Guttman教授課題組。其官方新聞稿對該研究有個很形象的比喻：假設(shè)人類的細(xì)胞核是一個碩大無比的圖書館，兩萬多條基因就類似于兩萬多本書。就像在圖書館中，主題接近的書要放在一起那樣，在細(xì)胞核里，不同的基因也需要在空間上進(jìn)行整理。但這并不是一件容易的事。如果將人類一個細(xì)胞內(nèi)的DNA首尾相接，拉成一條直線，可以長達(dá)數(shù)米。而細(xì)胞核內(nèi)的空間，卻只有在顯微鏡下才能看清。這些基因要如何在狹小的空間里整理到位呢？又比如，當(dāng)細(xì)胞需要調(diào)控特定基因的表達(dá)，細(xì)胞內(nèi)的元件又要怎么配合到位，找到合適的基因呢？答案可能就在RNA上。在這項(xiàng)研究中，科學(xué)家們開發(fā)了一種特殊的工具，能看清細(xì)胞核內(nèi)的RNA。具體來說，這種工具能給不同位置的RNA打上不同的標(biāo)簽。事后，只要回溯這些標(biāo)簽，就知道RNA原本在細(xì)胞內(nèi)處于什么位置。
而實(shí)驗(yàn)結(jié)果令人驚訝。利用這一工具，科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)細(xì)胞核的空間里，存在由數(shù)百條非編碼RNA搭建出的一個個“人工島”，將細(xì)胞核劃分成不同的區(qū)域。這些特殊的RNA還會招募其它關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子，將它們聚集到一個精準(zhǔn)的范圍內(nèi)。回到前面的比方，這些RNA就好像是圖書館里的書架，將細(xì)胞核里的信息整理到位。“這個工具改變了我們看RNA世界的方式，” Guttman教授說道，“這就像開發(fā)一種新的顯微鏡那樣，你能夠看到原來看不到的東西。發(fā)現(xiàn)RNA與空間組織之間的關(guān)系，只是冰山一角。未來我們將找到更多數(shù)據(jù)?！?/span>
▲細(xì)胞核內(nèi)充斥著由非編碼RNA組成的“人工島”（圖片來源：參考資料[2]；Credit: Courtesy of Inna-Marie Strazhnik）研究人員們指出，理解遺傳物質(zhì)在空間上如何組合，是理解生命的關(guān)鍵一步。相應(yīng)的，如果細(xì)胞核中的空間組合出現(xiàn)異常，就可能會引起多種疾病。未來，他們也計劃對比健康細(xì)胞和疾病細(xì)胞的細(xì)胞核差異，了解它們在空間組成上是否具有不同，從而理解細(xì)胞核內(nèi)的空間結(jié)構(gòu)與基因表達(dá)之間的關(guān)系。參考資料： [1] Sofia A. Quinodoz et al., (2021), RNA promotes the formation of spatial compartments in the nucleus, Cell, DOI:https:///10.1016/j.cell.2021.10.014 [2] The Vast Little Library Inside of Your Cells, Retrieved November 18, 2021, from https://www./about/news/the-vast-little-library-inside-of-your-cells
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