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【原】DMU在windows下安裝測試—外篇1

 育種數(shù)據(jù)分析 2021-11-18

DMU在windows下安裝測試—外篇1

1. 下載地址

下載地址:http://dmu./

64為電腦安裝DMUv6-R5-2-EM64T.msi, 32為電腦安裝DMUv6-R5-2.msi

2. 安裝DMU

3. 測試DMU是否安裝成功

3.1 保存測試數(shù)據(jù)

#dir.create("d:/ddmu-test")setwd("d:/ddmu-test/")library(devtools)
install_github("dengfei2013/learnasreml")library(learnasreml)
data("animalmodel.dat")
data("animalmodel.ped")
dat = animalmodel.dat
ped = animalmodel.ped
dmuped = ped
dmuped$Birth = 2018library(data.table)# write.table(dat,"animal-model.txt",row.names = F,col.names = F)fwrite(dat,"animal-model.txt",sep = " ",col.names = F)
fwrite(dmuped,"animal-ped.txt",sep = " ",col.names = F)

3.2 查看數(shù)據(jù)

3.3 將下面內(nèi)容保存為:Uni_animal.DIR

$COMMENT
Estimate variance components for BWT
Model
y: BWT
fixed: BYEAR + SEX
random: ANIMAL

$ANALYSE 1 1 0 0
$DATA  ASCII (4,2,0) d:/dmu-test/animal-model.txt
$VARIABLE
ANIMAL MOTHER BYEAR SEX
BWT TARSUS
$MODEL
1
0
1 0 3 3 4 1
1
0
0
$VAR_STR 1 PED 2 ASCII d:/dmu-test/animal-ped.txt
$PRIOR
1 1 1 0.3
2 1 1 0.7

注意, 先建立txt, 然后將其重命名為:Uni_animal.DIR, 這里DIR是后綴, 而不是默認的txt

3.4 找到DMU的安裝路徑, copy文件

我的默認的安裝路徑如下:C:\Program Files (x86)\QGG-AU\DMUv6\R5.2-EM64T\bin

將這些文件copy到你的數(shù)據(jù)文件夾下.

數(shù)據(jù)文件夾里面的內(nèi)容有:

3.5 打開cmd

  • 進入D盤

  • 進入文件夾:ddmu-test

  • 查看當前文件內(nèi)容

3.6 執(zhí)行命令

run_dmuai.bat Uni_animal

3.7 查看結(jié)果


4. 千里之行, 始于足下

能夠運行DMU的示例文件, 只是第一步, 隨后你可以看看示例數(shù)據(jù)是什么結(jié)構(gòu), 怎么調(diào)整自己的數(shù)據(jù), 怎么調(diào)整DIR文件, 加油, 祝你好運.

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