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KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因與基因組百科全書(shū)）是一個(gè)整合了基因組、化學(xué)和系統(tǒng)功能信息的綜合性數(shù)據(jù)庫(kù)，旨在揭示生命現(xiàn)象的遺傳物質(zhì)與化學(xué)藍(lán)圖。它是由日本京都大學(xué)生物信息學(xué)中心的Kanehisa實(shí)驗(yàn)室于1995年建立，是國(guó)際最常用的生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)之一，以“理解生物系統(tǒng)的高級(jí)功能和實(shí)用程序資源庫(kù)”著稱。 KEGG的網(wǎng)址：https://www./。 1. KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)
代謝（Metabolism），遺傳信息處理（Genetic Information Processing），環(huán)境信息處理（Environmental Information Processing），細(xì)胞過(guò)程（Cellular Processes），有機(jī)系統(tǒng)（Organismal Systems）,人類疾?。?/span>Human Diseases），藥物開(kāi)發(fā)（Drug Development），該表只列出了部分代謝通路，詳細(xì)的代謝通路信息見(jiàn)：https://www./kegg/pathway.html。 2. KEGG通路中ko和K等編號(hào)說(shuō)明
ko04010 -> KEGG Ontology 3. 如何理解KEGG通路-ko
查詢結(jié)果如下：
其中長(zhǎng)方形節(jié)點(diǎn)表示基因產(chǎn)物（如酶或一些RNA調(diào)節(jié)子），所有藍(lán)色背景的基因產(chǎn)物都屬于KEGG ORTHOLOGY（KO）分類體系（序列高度相似，并在同一條通路上有相似功能的蛋白質(zhì)被歸為一組KO），而白色背景的基因產(chǎn)物則不在KO分類體系之列。 通路中每個(gè)元素類型說(shuō)明：
https://www./kegg/document/help_pathway.html 4. 如何理解KEGG的蛋白和酶促反應(yīng)編號(hào) 查詢KEGG的蛋白質(zhì)或者酶分類編號(hào)的具體功能描述和參與代謝通路方法如下，以K10258為例。  查詢結(jié)果如下：
查詢KEGG的酶促反應(yīng)編號(hào)的具體信息如下，以R00259為例。
查詢結(jié)果如下：
5. 蛋白序列在線KEGG注釋 在基因組研究中，特別是當(dāng)組裝了一個(gè)新物種的基因組，我們首先要做的就是注釋，從而大致推斷這些基因的功能。KEGG提供了在線注釋功能，進(jìn)入KEGG中自動(dòng)注釋工具界面，KAAS(http://www./tools/kaas/)，如下圖，以KAAS job request(BBH method)為例。
點(diǎn)擊KAAS job request(BBH method)進(jìn)入注釋界面，提交注釋序列：
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