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講邏輯太沉重,還是講講信號通路工具來調(diào)劑一下哈 。其實(shí)仿佛幾年前給你們講過Pathway Commons,但現(xiàn)在再來看看,感覺已經(jīng)不太一樣了(現(xiàn)在想想一個(gè)能維持運(yùn)營幾年的工具,應(yīng)該還不算差了)。 
比如這個(gè)常用的工具PathViz就直接在首頁上顯示了 : 
輸入一個(gè)或者多個(gè)基因,就能形成他們之間的Pathway關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)圖 ,比如P53和MDM2: 
在Node間的Edge上,點(diǎn)擊一下 ,就能顯示兩者關(guān)聯(lián)的具體方式以及相關(guān)文獻(xiàn): 
當(dāng)然,PathViz只是Pathway Commons的一個(gè)工具 ,Pathway Commons主要的功能還是搜信號通路,比如我們還是搜一個(gè)P53: 
也一樣是這樣的network圖 : 
但具體的調(diào)控就變得更加細(xì)化了 : 
點(diǎn)擊后就是一長串的文獻(xiàn)證據(jù) : 
或者只是點(diǎn)擊含有P53的信號通路圖, 比如P53調(diào)控P21表達(dá),就是這樣的: 
在步驟的節(jié)點(diǎn)上,也會顯示出箭頭反應(yīng)的具體過程 ,以及相關(guān)文獻(xiàn): 
總之在信號通路的瀏覽及搜索上 ,Pathway Commons還是挺有意思的一個(gè)工具。 好了,要也閑得無聊用一下信號通路分析的話,可以自己去百度一下,實(shí)在不行就回復(fù)“公克”(不要在評論區(qū)回復(fù) ),要么就直接星球上見(當(dāng)然,進(jìn)不去也無所謂 )。好吧,今天就先給你們策到這里吧,祝你們心明 眼亮 。
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