|
Meta簡明教程目錄 5.Meta分析數(shù)據(jù)提取| Meta簡明教程(5) 6.一文學(xué)會revman軟件| Meta簡明教程(6) Meta簡明教程(7) 上一期介紹了Revman 軟件對二分類數(shù)據(jù)、連續(xù)型數(shù)據(jù)、 診斷性試驗(yàn)數(shù)據(jù)、 生存-時間數(shù)據(jù)進(jìn)行meta分析,本期將利用Stata對以上數(shù)據(jù)進(jìn)行meta分析。大家可以到本公眾號下載Stata軟件(重磅推薦:分類最全的統(tǒng)計(jì)分析相關(guān)軟件,了解一下?請關(guān)注、收藏以備用) Stata12.0 界面 一、二分類數(shù)據(jù)分析 數(shù)據(jù)形式 例:研究阿司匹林(aspirin)預(yù)防心肌梗死(MI)7個臨床隨機(jī)對照試驗(yàn),觀察死亡率,數(shù)據(jù)提取如下: 操作步驟 1.構(gòu)建數(shù)據(jù) 1)啟動Stata 12.0 軟件后,可以直接點(diǎn)擊工具欄中DataEditor (edit)按鈕。 也可在在菜單欄中點(diǎn)擊Data→Data Editor→ DataEditor (edit),出現(xiàn)以下界面。 2)點(diǎn)擊變量名位置,依次輸入研究名稱(research),阿司匹林組死亡數(shù)(a),阿司匹林組存活數(shù)(b),安慰劑組死亡數(shù)(c),安慰劑組存活數(shù)(d) 3)錄入數(shù)據(jù):在變量值區(qū)域輸入數(shù)據(jù) 2. 數(shù)據(jù)分析 1)導(dǎo)入meta模塊: 在Command窗口中進(jìn)行編程,首先需要在Stata中安裝meta模塊:在Command窗口輸入“ssc install metan”,選中點(diǎn)回車。結(jié)果窗口中出現(xiàn)下面的結(jié)果,說明已經(jīng)安裝了meta模塊。 2)輸入meta分析代碼: 在Command窗口輸入 “Command窗口輸入 “metan a b c d, or fixed”,點(diǎn)回車,完成結(jié)果分析。a,b,c,d分別代表阿司匹林組死亡數(shù),阿司匹林組存活數(shù),安慰劑組死亡數(shù),安慰劑組存活數(shù),or代表效應(yīng)指標(biāo)為OR值,fixed代表選用固定效應(yīng)模型。相應(yīng)的可以用rr 及random替換代碼。 結(jié)果 1.合并效應(yīng) 2.森林圖 二、連續(xù)型數(shù)據(jù)分析 數(shù)據(jù)形式 例:研究小劑量潑尼松和安慰劑治療類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的7個臨床隨機(jī)對照試驗(yàn),觀察類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎患者的關(guān)節(jié)壓痛指數(shù),數(shù)據(jù)提取如下: 操作步驟 1.構(gòu)建數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)的構(gòu)建和二分類的步驟相同,需要設(shè)置的變量名有研究名稱(research)、試驗(yàn)組樣本量(tn),試驗(yàn)組均數(shù)(tmean),試驗(yàn)組標(biāo)準(zhǔn)差(tsd),對照組均數(shù)(cmean),對照組標(biāo)準(zhǔn)差(csd)。 2. 數(shù)據(jù)分析 1)導(dǎo)入meta模塊(與二分類數(shù)據(jù)一致,如果已經(jīng)導(dǎo)入可跳過此步驟) 2)輸入meta分析代碼: 在Command窗口輸入 “metan tn tmean tsd cn cmean csd, fixed”,點(diǎn)回車,完成結(jié)果分析。tn tmean tsd分別代表試驗(yàn)組樣本量、均數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差,cncmean csd分別代表對照組樣本量、均數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)差,fixed代表選用固定效應(yīng)模型。如果計(jì)算合并均差(WMD)需要在fixed后加nostandard,如果不加,默認(rèn)合并標(biāo)化均差(SMD)。 結(jié)果 1.合并效應(yīng)
2. 森林圖
三、診斷性試驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析 數(shù)據(jù)形式 例:研究ProGRP和NSE對小細(xì)胞肺癌診斷10個診斷試驗(yàn),觀察ProGRP對小細(xì)胞肺癌的診斷價值,數(shù)據(jù)提取如下:
操作步驟及結(jié)果 1.構(gòu)建數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)的構(gòu)建和二分類的步驟相同,需要設(shè)置的變量名有研究名稱(research)、真陽性(tp)、假陽性(fp)、假陰性(fn)、真陰性(tn)。
2.數(shù)據(jù)分析 1)導(dǎo)入診斷性試驗(yàn)meta分析模塊: 在Command窗口輸入 “sscinstall midas” ,點(diǎn)回車,結(jié)果窗口顯示
2)效應(yīng)值合并: 在Command窗口輸入 “midas tp fp fn tn, res(sum)”,點(diǎn)回車,完成結(jié)果分析。tp fp fn tn真陽性、假陽性、假陰性、真陰性例數(shù),res(sum)代表計(jì)算合并點(diǎn)值,包括靈敏度、特異度、陽性似然比、陰性似然比、診斷比值比。
3)森林圖繪制 在Command窗口輸入 “midas tp fp fn tn, ford fors bfor(dss)”,點(diǎn)回車, 完成結(jié)果分析。tp fp fn tn真陽性、假陽性、假陰性、真陰性例數(shù). Ford代表研究的置信區(qū)間,fors代表異質(zhì)性結(jié)果的分析,bfor(dss)列出每一項(xiàng)研究。
4)SROC曲線繪制 在Command窗口輸入 “midas tp fp fn tn, plot sroc(both)”,點(diǎn)回車, 完成結(jié)果分析。Plot sroc(both)代表繪制SROC曲線。
四、生存-時間數(shù)據(jù)分析 數(shù)據(jù)形式 例:結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移生存風(fēng)險的3個臨床研究,觀察肝轉(zhuǎn)移對結(jié)直腸癌生存風(fēng)險比的影響,數(shù)據(jù)提取如下:
操作步驟 1.構(gòu)建數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)的構(gòu)建和二分類的步驟相同,需要設(shè)置的變量名有研究(research),風(fēng)險比(hr),風(fēng)險比置信區(qū)間下限(lci),風(fēng)險比置信區(qū)間上限(uci)。
2.數(shù)據(jù)分析 1)導(dǎo)入meta模塊(與二分類數(shù)據(jù)一致,如果已經(jīng)導(dǎo)入可跳過此步驟) 2)輸入meta分析代碼: 在Command窗口輸入 “metan hr lci uci, effect(HR) fixed”,點(diǎn)回車,完成結(jié)果分析。hr、lci、uci分別代表各研究風(fēng)險比,風(fēng)險比置信區(qū)間下限,風(fēng)險比置信區(qū)間上限,effect(HR)代表效應(yīng)量,fixed代表選用固定效應(yīng)模型。 結(jié)果 1.合并效應(yīng)
2.森林圖
五、總結(jié) 相比于Revman,Stata操作步驟更為簡單,而且靈活多樣,功能也比Revman強(qiáng)大,但Stata主要是代碼界面,需要進(jìn)行簡單編程,上手比Revman難。 掃碼關(guān)注我們 了解更多醫(yī)學(xué)論文寫作方法、真實(shí)世界研究統(tǒng)計(jì)分析方法,請關(guān)注公眾號:“醫(yī)學(xué)論文與統(tǒng)計(jì)分析”或“medicalstat” |
|
|