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實(shí)操:通過(guò)SEER數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)一篇SCI系列(二)

 大壯歌 2019-09-08

上周自我時(shí)間管理不夠嚴(yán)謹(jǐn),導(dǎo)致作業(yè)拖到這周。不過(guò),自己在《通過(guò)SEER數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)一篇SCI系列》路上繼續(xù)前進(jìn)中,上周進(jìn)步主要在兩個(gè)方面:

第一:嘗試從seerstat上下載lung cancer數(shù)據(jù),并通過(guò)EXCEL處理。

第二:下載R和Rstudio,并試運(yùn)行數(shù)據(jù)成功。

下載數(shù)據(jù)并保存至EXCEL

1.打開(kāi)seerstat軟件,依次點(diǎn)擊'File'—'New'—'CaseListing Session'

2.點(diǎn)擊最上面一行

3.選擇'Selection'-'Edit'– 'Site and Morphology'

4.選擇'CS schema v0204+'

5.選擇'lung'-點(diǎn)擊OK

6.再選擇右邊Table

7.選擇相應(yīng)的應(yīng)變量和自變量,如'age'、'race'、'sex'、'TNM分期'、'survival month'、'vital status recode'

8.選擇工具欄'Execute'打雷樣圖標(biāo)

9.生成下面數(shù)據(jù)欄后,點(diǎn)擊工具欄'Matrix'-'Export' –'Resultas Text File'

10.一個(gè)完整的大數(shù)據(jù)被成功導(dǎo)出并保存至EXCEL中

下載R和RStudio,并試運(yùn)行數(shù)據(jù)

1.R語(yǔ)言是統(tǒng)計(jì)領(lǐng)域廣泛使用的工具,是屬于GNU系統(tǒng)的一個(gè)自由、免費(fèi)、源代碼開(kāi)放的軟件,是用于統(tǒng)計(jì)計(jì)算和統(tǒng)計(jì)繪圖的優(yōu)秀工具。而RStudio是R的集成開(kāi)發(fā)環(huán)境,用它進(jìn)行R編程的學(xué)習(xí)和實(shí)踐會(huì)更加輕松和方便。

下載R及RStudio,網(wǎng)址見(jiàn):

https://blog.csdn.net/to_Baidu/article/details/52904348

2.數(shù)據(jù)試運(yùn)行結(jié)果(多因素cox回歸模型):

這就是上周的攻克進(jìn)度,速度有些慢,這周繼續(xù)加油!

最后送給自己一碗毒雞湯:

不怕自己距離南極有多么遙遠(yuǎn),就怕自己今天沒(méi)有前進(jìn),哪怕是一小步。

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