首先就是政權合法性的問題。像瑯琊王司馬睿，在南京建立東晉政權的時候，西晉的宗室要么死于八王之亂，要么死于五胡亂華，所以司馬睿當皇帝也是名正言順。趙構建立南宋政權的時候，北宋的宗室也都因為靖康之恥被俘虜了，所以他也算是合法繼承人。但是到了南明可就不一樣了，由于江南明朝的宗室過多，再加上崇禎帝死的時候也沒有立誰為繼承人，南明的宗室誰也不服誰，都只顧內斗了，誰也沒有心思去抗清。所以不到20年，南明政權就換了四個皇帝，可是誰也沒有真正統(tǒng)一江南。沒有凝聚力，無法形成統(tǒng)一的政權，可以說是明朝滅亡的一個重要原因。

其次從面臨的形式來說。當時東晉開國的時候，北方的胡人都在互相內耗，根本沒有心思顧及東晉。南宋開國的時候，金人同樣也在考慮要不要滅掉南宋，但西夏、北遼和北方的抗金武裝牽扯他們太多精力，也就放下了吞并南宋的想法。但到了南明可就不一樣了，當時清廷內部凝聚力較強，心里只有統(tǒng)一中國的想法，再加上和蒙古達成聯(lián)盟，并且讓朝鮮變成了附屬國，解決了后顧之憂。

再次是軍事上的原因，東晉依靠大量的流民和世家的武裝，建立了著名的北府兵。趙構在靖康之變的時候，就被宋欽宗任命為天下兵馬大元帥，可以指揮除京城外的所有軍隊，南宋更是有岳飛、韓世忠、宗澤的等名將，反觀南明，袁崇煥、孫傳庭等大將早就死了，南明又沒有什么能打的軍隊，像高杰、左良玉打仗不行，反而和軍閥差不多，朝廷根本控制不了他們。

最后也就是民心了，東晉開國的時候，逃到江南的老百姓經(jīng)歷了五胡亂華的慘狀，對胡人充滿仇恨，自然會擁護東晉政府。南宋開國的時候，由于金軍濫殺無辜，加上宋高宗改革了一些措施也得到了擁護?？墒堑搅四厦鞯臅r候，滿清學聰明了，實行了一些減稅的措施，可是這時候南明反而加重賦說，就這樣失去了民心。

假如南明能夠團結一心，一致抗清。說不定還有一線希望，可是各個藩王之間只顧內斗，甚至還發(fā)生了三王之亂這樣的事件，不能不說可悲啊！