這個問題，在4.15-16日大力稅手的匯算清繳問題解決大會上有過討論，也是突破了小編的常規(guī)理解，我們先來看看一個地方稅務(wù)機關(guān)的口徑，是今年新發(fā)的，但卻是非通過官方公開發(fā)布的意見：

十一、問：目前高新技術(shù)企業(yè)、技術(shù)先進型服務(wù)企業(yè)以及軟件企業(yè)和集成電路產(chǎn)業(yè)在計算收入占比時，債券類、股權(quán)類投資轉(zhuǎn)讓收入按轉(zhuǎn)讓所得計入收入總額。研發(fā)費用加計扣除負面清單判定的收入總額口徑是否與此一致，請市局予以明確。

答：在判定研發(fā)費用加計扣除負面清單行業(yè)時，有關(guān)債權(quán)類、股權(quán)類投資轉(zhuǎn)讓收入的確定與上述口徑一致。即：“收入總額”和“投資收益”確認時設(shè)計（宜為“涉及”）債權(quán)類、股權(quán)類投資轉(zhuǎn)讓的，按轉(zhuǎn)讓所得計入“收入總額”和“投資收益”，并以此作為依據(jù)確認相關(guān)指標(biāo)比例。

我們下面要看三個方面的內(nèi)容：

一是納稅申報表：

“（一）收入總額”：填報納稅人本年以貨幣形式和非貨幣形式從各種來源取得的收入，為收入總額。包括：銷售貨物收入，提供勞務(wù)收入，轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)收入，股息、紅利等權(quán)益性投資收益，利息收入，租金收入，特許權(quán)使用費收入，接受捐贈收入，其他收入。

二是企業(yè)所得稅法實施條例：

第十六條　企業(yè)所得稅法第六條第（三）項所稱轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)收入，是指企業(yè)轉(zhuǎn)讓固定資產(chǎn)、生物資產(chǎn)、無形資產(chǎn)、股權(quán)、債權(quán)等財產(chǎn)取得的收入。

三是高新認定的規(guī)定：

總收入是指收入總額減去不征稅收入。

收入總額與不征稅收入按照《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》（以下稱《企業(yè)所得稅法》）及《中華人民共和國企業(yè)所得稅法實施條例》（以下稱《實施條例》）的規(guī)定計算。

四是關(guān)于研究開發(fā)費用加計扣除中的收入總額的理解：

不適用加計扣除政策行業(yè)的判定

《通知》中不適用稅前加計扣除政策行業(yè)的企業(yè)，是指以《通知》所列行業(yè)業(yè)務(wù)為主營業(yè)務(wù)，其研發(fā)費用發(fā)生當(dāng)年的主營業(yè)務(wù)收入占企業(yè)按稅法第六條規(guī)定計算的收入總額減除不征稅收入和投資收益的余額50%（不含）以上的企業(yè)。

如何理解研發(fā)加計扣除中的“投資收益”扣除呢？顯然這是會計理念與稅法口徑的差異理解，而某地稅務(wù)機關(guān)的理解，顯然是有利于納稅人的意見，于此財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓在扣除時，還是要扣除財產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收入、股息紅利等投資收益為準，

而總局在研發(fā)加計的指引中提到：收入總額按企業(yè)所得稅法第六條的規(guī)定計算。從收入總額中減除的投資收益包括稅法規(guī)定的股息、紅利等權(quán)益性投資收益以及股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得。

這兒提到的股權(quán)轉(zhuǎn)讓所得，似乎又打亂了我們理解的股權(quán)轉(zhuǎn)讓收入的理解，因此于高新的研發(fā)口徑時，這個轉(zhuǎn)讓所得還是轉(zhuǎn)讓收入，就努力找到有利的方式來解決吧，某市的意見，大家可以考慮參照，盡管小編認為還是有點邏輯上的不充分之處。