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圖1: 理想情況下PCR產物與循環(huán)數關系 圖2 理論情況下PCR產物量與循環(huán)數關系。 圖3 實際情況下PCR產物數與循環(huán)數的關系 剛開始的時候酶,緩沖液,能量,dNTP等都是充足的,PCR按照理論情況下的擴增(A: 指數期),限速因子為底物的量; 隨著時間的增加,產物越來越多,每次循環(huán)所需要的酶也就越來越多,當達到B(線性期)階段的時候,所有的酶都參與了擴增,因此每個循環(huán)之后產物增加量是恒定的,和酶的數量相關,此時限制產物增加的因素是酶; 當達到C(衰退期)階段時候,酶逐漸失活,dNTP消耗殆盡,產物增加量逐漸減少; 直至到D階段,沒有任何產物生成,數目保持恒定。 我們可以將每條PCR產物帶上一個熒光標記(具體怎么回事下節(jié)講解),這樣的話有多少個PCR產物就有多少單位的熒光,因此: 熒光 正比于 DNA產物數目 某種關系于 DNA初始量 因此我們通過機器收集熒光的量就能知道DNA初始量了,那么機器如何收集熒光呢? 圖4 固定循環(huán)數測定熒光強度值 圖5 固定熒光強度測試循環(huán)數 只要我們把R0設置合適,R0這條水平線就能切割到所有的處于對數期的曲線,我們qPCR采用的就是這種模式,下面我們來看下為什么這種模式能夠反映出DNA初始量(以下推導中l(wèi)g代表以2為底的對數)。 一大波推導公式來襲~可直接看最后公式 如果你有一個實驗組和一個對照組,那么實驗組比對照組的比值就是2^-△△Ct,意思就是說實驗組的mRNA水平是對照組的多少倍(Fold change)。 那么為什么不能用圖4(固定循環(huán)數,測最終熒光強度值)的方式來衡量初始濃度呢?那是因為固定循環(huán)數的情況下,有很多樣品不處于對數期,熒光的量與初始濃度沒有特定的關系,無法計算初始濃度。 好了,不知道你是否已經明白其中的原理,我們下一節(jié)將介紹qPCR儀器運行的原理,讓你真正理解qPCR~ “這哪是最清晰的QPCR講解???” “客官請息怒,科研狗會努力做好,希望提出寶貴意見!汪汪汪” |
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