《醫(yī)宗金鑒》經過三年時間完成，共90卷，15個分冊。即傷寒17卷、金匱8卷，名醫(yī)方論8卷，四診1卷，運氣1卷，傷寒心法3卷，雜病心法5卷，婦科心法6卷，幼科心法6卷，痘疹心法 4卷，種痘心法1卷，外科心法16卷，眼科心法2卷，針灸心法8卷，正骨心法4卷。該書特點 ：圖、說、方、論俱備，歌訣助誦。細讀之有著十分明顯的時代性，適應18世紀中國疾病譜 。例如：公元17-18世紀，康熙、乾隆由于天花危害甚大，對太醫(yī)院壓力更大，因此，太醫(yī)院在分科設置上也有明顯的反映，如將痘疹作為一科從幼科中分立出來，在《醫(yī)宗金鑒》中也單獨成冊，特別還將《種痘心法》作為一卷與幼科心法并列，可見對天花一病的專 門研 究與防治得到了高度重視，促成幼科被分解為三科。由于接種人痘的推廣與普及，天花之危害明顯降低，太醫(yī)院又將痘疹一科合并回幼科。另外，還有對正骨一科整理提高也十分明顯 ，通過《醫(yī)宗金鑒》的編纂，使中國歷代相傳的正骨理論與技術更加系統(tǒng)，更將宮廷上駟院綽班 (正骨) 處的豐富經驗融為一體，使太醫(yī)院正骨科與上駟院綽班處合并一處，理論與技術均得到提高 。