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是時候拿出神器了!——如何搜索某一分子涉及的信號通路

 海陵島的魚 2017-05-16

神器在手,天下我有!

    小黑所在的實驗室主要研究蛋白泛素降解。

    這一天老板對小黑說,上次布置給你的給大家講講蛋白泛素系統(tǒng)任務,明天講下,一定要簡要,但也要全面,10分鐘左右。

    收到通知后,小黑如坐針氈,因為小黑以為上次老板只是說說而已。小黑暗自思忖:離明天匯報還剩16個小時38分鐘,今天晚上就不睡了,用1個小時來搜索文獻,15個小時看15篇文獻,38分鐘來做PPT。

    小黑立即在PUBMED上面輸入 “ubiquitin”:



    如果是一個新手,5萬多篇的文獻肯定會感到絕望無助。但是小黑是什么人啊,小黑就是掌握著實驗高科技的人,他對PUBMED搜索了如指掌。


1小時后:

小黑下載了20篇文獻,超出預期目標5篇,超額33%完成了預訂目標。

2小時后:

小黑看完了第一篇文獻,圓滿完成預期目標。

3小時后

小黑第二篇文獻還差一節(jié)。

4小時后

小黑第二篇剛看完。

5小時候

小黑睡著了….

一覺醒來,距離匯報2小時,

“沒事,我覺得我還可以再看一篇”


距離匯報還剩1小時,

小黑看完的文獻在腦海中揉成了一團漿糊,


怎么辦?

一世英名就要毀于一旦?

在師妹們新中偉岸的形象就要完蛋?


是時候亮出神器了

KEGG Pathway

不論你做的課題是蛋白泛素系統(tǒng)



還是病毒與腫瘤:


都能找到相關的信號通路總結(jié)。

實在是居家旅行,實驗撩妹,必備工具


KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系統(tǒng)分析基因功能、基因組信息數(shù)據(jù)庫,它有助于研究者把基因及表達信息作為一個整體網(wǎng)絡進行研究?;蚪M信息存儲在GENES數(shù)據(jù)庫 里,包括完整和部分測序的基因組序列;更高級的功能信息存儲在PATHWAY數(shù)據(jù)庫里,包括圖解的細胞生化過程如代謝、膜轉(zhuǎn)運、信號傳遞、細胞周期,還包 括同系保守的子通路等信息。


這個神器究竟在哪里?在下面:

http://www./kegg/pathway.html


下面截取一些信號通路列表:


趕快去看看你研究的分子和誰有瓜葛吧!


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