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AME PubMed實(shí)用技巧|PubMed、PMC、MEDLINE再也不會(huì)傻傻分不清

 廣州平淡 2016-09-27

我們剛接觸生物醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索的時(shí)候,面對(duì)PubMed、PMC(PubMed Central)和MEDLINE,經(jīng)常會(huì)產(chǎn)生以下疑惑:


  • 它們到底有什么區(qū)別和聯(lián)系?

  • 它們的收錄范圍有什么區(qū)別?

  • 它們的檢索詞有什么各自特點(diǎn)?

  • 為什么檢索結(jié)果數(shù)量不同?

  • 平時(shí)檢索時(shí)候用什么數(shù)據(jù)庫更方便?

……


一、PubMed、PMC和MEDLINE到底有什么區(qū)別和聯(lián)系?


PubMed誕生于1996年。作為目前最常用的文摘型數(shù)據(jù)庫,PubMed迄今為止已經(jīng)收錄了超過2500萬條文獻(xiàn)記錄。其收錄范圍不僅包括Medline,還有即將收錄至Medline的處理中數(shù)據(jù)、期刊被Medline收錄但是文章已經(jīng)優(yōu)先出版的文獻(xiàn)、生命科學(xué)期刊出版商提交到PMC的文獻(xiàn)、NIH基金資助作者的文獻(xiàn)和NCBI書籍等。PubMed還提供鏈接到文獻(xiàn)全文所在網(wǎng)站的全文鏈接。


久負(fù)盛名的MEDLINE始建于1966年(追溯收錄至1946年),是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館(National Library of Medicine,NLM)期刊文獻(xiàn)記錄數(shù)據(jù)庫。目前為止,MEDLNE已經(jīng)收錄超過5600種生物醫(yī)學(xué)及生命科學(xué)相關(guān)學(xué)術(shù)期刊,文獻(xiàn)記錄數(shù)量逾兩千萬條。1983年,MEDLINE推出電子版,網(wǎng)上數(shù)據(jù)每日更新,光盤版每月更新。MEDLINE有嚴(yán)格的文獻(xiàn)選擇委員會(huì)(the Literature Selection Technical Review Committee ,LSTRC)進(jìn)行選刊,選刊標(biāo)準(zhǔn)基于MEDLINE選刊指南,包括原創(chuàng)性、科學(xué)性及全球讀者重要性等方面。目前MEDLINE的文獻(xiàn)都收錄在PubMed中。


PMC全稱為PubMed Central,建立于2000年,由NCBI進(jìn)行管理,是可以免費(fèi)獲取全文的生物醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)全文數(shù)據(jù)庫,保存了NLM收錄印刷雜志的電子副本。PMC的核心原則是開放獲取全文。PMC并不出版文獻(xiàn),而是收集參與雜志及符合研究資助條件的作者提交文獻(xiàn)全文。


二、PubMed、PMC和MEDLINE收錄范圍有什么區(qū)別和聯(lián)系?



圖1. PubMed、PMC和MEDLINE收錄范圍圖示


PMC的絕大部分文獻(xiàn)都能在PUBMED中搜索到,只有一小部分圖書評(píng)論(book reviews)是沒在pubMed收錄范圍內(nèi)的。


三、PubMed、PMC和MEDLINE檢索詞有什么各自特點(diǎn)?


MEDLINE支持主題詞檢索、字段限定檢索、截詞檢索和自由詞檢索,需要檢索人員根據(jù)需要人工選定合適的檢索方式進(jìn)行檢索。PubMed不僅具有MEDLINE的檢索方式,還可以執(zhí)行自動(dòng)匹配(Automatic Term Mapping,ATM)。PMC也可以進(jìn)行PubMed一樣的主題檢索、自動(dòng)匹配檢索(ATM)等,但是PMC由于收錄了全文, 可以額外進(jìn)行全文檢索。


四、PubMed、PMC和MEDLINE為什么檢索結(jié)果數(shù)量不同?


  • 在PubMed中自由詞檢索時(shí),會(huì)檢索整個(gè)PubMed的收錄范圍,其范圍大于MEDLINE。尤其是會(huì)有新近半年被收錄的文獻(xiàn)記錄并未被標(biāo)注MESH,此時(shí)只能用自由詞檢索到。

  • 當(dāng)在PubMed中限定MESH詞或MEDLINE子集時(shí),其檢索結(jié)果只會(huì)顯示MEDLINE的數(shù)據(jù)。

  • PubMed收錄范圍是包括Medline和PMC數(shù)據(jù)的,但是我們使用自由詞檢索的時(shí)候PMC的檢索結(jié)果反而更多,這是為什么呢?因?yàn)镻MC收錄了全文, 可以額外進(jìn)行全文檢索,所以檢索結(jié)果較多,這也導(dǎo)致了PMC查準(zhǔn)率較差。


五、PubMed、PMC和MEDLINE,我們?cè)撚媚膫€(gè)?


綜上所述,三者特點(diǎn)比較如表1。最適于使用的還是PubMed,其無愧于當(dāng)今世界查找生物醫(yī)藥文獻(xiàn)利用率最高的數(shù)據(jù)庫。


表1. PubMed、PMC和MEDLINE的特點(diǎn)總結(jié)


六、訪問方式:


PubMed:使用下列網(wǎng)址都能訪問到

http://www.

http://www.

http://www.

http://www.ncbi.nlm./pubmed/


Medline:可以在pubmed中限定medline子集。在web of science平臺(tái)、embase數(shù)據(jù)庫、ovid平臺(tái)也能檢索到medline的數(shù)據(jù)。也可以使用medline光盤版。


PMC地址:

http://www.

http://www.

http://www.ncbi.nlm./pmc/


參考文獻(xiàn):


  1. https://www.nlm./pubs/factsheets/medline.html

  2. http://www.ncbi.nlm./pmc/about/intro/

  3. http://www.ncbi.nlm./books/NBK3825/

  4. 崔雷等.《臨床信息管理》. 人民衛(wèi)生出版社 . 2014

  5. http://www./library/lanmu/library/lanmu/daohang/pubmed.htm


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