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根據(jù)解密檔案中石井四郎等人的供述、美軍的問訊記錄、731部隊(duì)成員提供的文件資料，以及駐日美軍同美國國防部、聯(lián)合參謀部之間的往來電文等500余頁解密檔案，2013年9月10日，哈爾濱市社科院731國際問題研究中心，披露了美軍掩蓋731部隊(duì)的戰(zhàn)爭責(zé)任并與其開展秘密交易的過程，石井四郎等戰(zhàn)犯未被審判確系美日交易。中國社科院刊物《抗日戰(zhàn)爭研究》不久前刊載了這項(xiàng)研究成果《掩蓋與交易：二戰(zhàn)后美軍對(duì)石井四郎的調(diào)查》。
一、“1945年關(guān)東軍防疫給水部的軍方代號(hào)是‘滿洲第659部隊(duì)’，其下轄的‘滿洲第731部隊(duì)’是石井部隊(duì)平房本部的代號(hào)?！?/font>
731部隊(duì)是一支頗為神秘的部隊(duì)，由于大部檔案資料被銷毀，致使對(duì)該部隊(duì)設(shè)立時(shí)間的結(jié)論難以考證。楊彥君表示，731部隊(duì)1936年成立的說法目前得到了學(xué)術(shù)界普遍認(rèn)同，但1936年何月何日設(shè)立一直沒有結(jié)論。
 哈爾濱侵華日軍第731部隊(duì)罪證陳列館中保存著一張照片，這是“滿州第731部隊(duì)高等官團(tuán)”在本部大樓前后集體合影，落款處日文漢字寫著“昭和十八年六月二十五日第八個(gè)創(chuàng)設(shè)紀(jì)念日”。日文“創(chuàng)設(shè)”即為初次設(shè)置、設(shè)立之意，“第八個(gè)創(chuàng)設(shè)紀(jì)念日”即“設(shè)立八周年紀(jì)念日”，昭和十八年即公歷1943年。以此推算，1936年6月25日應(yīng)是731部隊(duì)的正式設(shè)立時(shí)間。
據(jù)美國國家檔案館館藏英文檔案《湯普森上校對(duì)石井四郎中將的問訊速記文稿》記載：“湯普森問：你在何時(shí)任哈爾濱研究所負(fù)責(zé)人？石井四郎答：1936年至1942年6月，第二階段是1945年3月到二戰(zhàn)后?！惫枮I研究所即731部隊(duì)，石井四郎認(rèn)為是在1936年正式批準(zhǔn)設(shè)立的“研究所”之后才是正式的“負(fù)責(zé)人”，1936年成為731部隊(duì)設(shè)立的時(shí)間標(biāo)志。
 一份名為“關(guān)東軍防疫給水部滿洲第六五九部隊(duì)留守名簿”的檔案，是一名731部隊(duì)成員的檔案資料，1945年1月1日，該人當(dāng)時(shí)在北安陸軍醫(yī)院工作。這份檔案目前保存在日本厚生勞動(dòng)省。 石井四郎離哈時(shí)擁有百萬日元現(xiàn)金
1946年2月5日，美國人在石井四郎家中對(duì)其進(jìn)行了第一次問詢。隨后，美國湯普森中校多次問訊石井四郎，并撰寫了48頁的報(bào)告。
目前美國國家檔案館里保存著一份名為“石井四郎卷宗”的解密文件，石井四郞是731部隊(duì)首任部隊(duì)長。在檔案中看到，1945年12月28日情報(bào)記錄：石井四郎離開(哈爾濱)時(shí)擁有大約100萬日元的巨額現(xiàn)金。
日本無條件投降后，石井四郎等人逃回日本，極力掩蓋在731部隊(duì)的經(jīng)歷。但二戰(zhàn)結(jié)束前，美國已得知日本在中國進(jìn)行了細(xì)菌戰(zhàn)。1945年9月，美國細(xì)菌戰(zhàn)專家桑德斯中校開始調(diào)查日本細(xì)菌戰(zhàn)情況。他從被問訊的731部隊(duì)重要成員那里調(diào)查到了731部隊(duì)的核心機(jī)密：“進(jìn)行大量努力把生物戰(zhàn)發(fā)展為有實(shí)用價(jià)值的武器，至少實(shí)驗(yàn)了8種用于大規(guī)模散播細(xì)菌的特殊炸彈……”
1945年12月3日，駐日美軍的情報(bào)線人提供了石井四郎，于1945年11月10日在老家千葉縣山武郡千代田村舉行了偽裝葬禮并潛伏起來，此時(shí)距離東京審判開始只有不到3個(gè)月時(shí)間。
檔案里記錄，1946年2月5日，美國人在石井四郎家中對(duì)其進(jìn)行了第一次問詢。在隨后的一個(gè)多月時(shí)間里，湯普森中校多次問訊石井四郎，并撰寫報(bào)告記述了石井四郎的從軍履歷以及關(guān)東軍防疫給水總部的體制、配置、任務(wù)和職責(zé)等情況，其中包括細(xì)菌武器的研制、對(duì)細(xì)菌戰(zhàn)防御的研究、人體實(shí)驗(yàn)等信息。
2005年8月４日，當(dāng)年日本７３１部隊(duì)負(fù)責(zé)人石井四郎的兩本筆記本在其原親信的家中被發(fā)現(xiàn)。
兩本筆記本的封面上，分別用鉛筆寫有“１９４５－８－１６終戰(zhàn)當(dāng)時(shí)筆記”和“終戰(zhàn)筆記１９４６－１－１１ 石井四郎”等字樣。據(jù)認(rèn)為這是石井在日本戰(zhàn)敗后不久寫下的備忘錄。在“１９４５年”的筆記中，有關(guān)于蘇聯(lián)對(duì)日宣戰(zhàn)后石井從由東京到新京（現(xiàn)長春）的司令官那里接到要求銷毀一切證據(jù)物件的命令等記載：“司令官訪問新京／決定全部炸毀焚燒，并認(rèn)真防諜”。
據(jù)關(guān)東軍司令部的朝枝繁春參謀回憶說，他飛往新京（今長春），在軍用機(jī)場的一座機(jī)庫里與石井四郎交談了1小時(shí)左右，并傳達(dá)了軍部的詳細(xì)指示：
1.貴部全體解散，讓部隊(duì)成員盡早返回日本本土，所有證據(jù)物品都必須永遠(yuǎn)地從地球上消失得無影無蹤。
2.為此，我已經(jīng)作出安排，調(diào)一個(gè)工兵中隊(duì)攜帶5噸炸藥歸貴部指揮使用，必須將所有的設(shè)施炸毀。
3.建筑物內(nèi)的“丸太”（俘虜），必須用電動(dòng)機(jī)加以處理，再放進(jìn)貴部鍋爐內(nèi)焚燒，然后將其骨灰等投入松花江沖走。
4.貴部53名具有博士頭銜的軍醫(yī)，必須用軍用飛機(jī)直接運(yùn)回日本本土。
石井四郎聽完命令就要回去時(shí)，忽地停下腳步，轉(zhuǎn)過頭來不甘心地追問朝枝：“研究資料也不能帶回去嗎?”
“不，不能帶回去！”朝枝當(dāng)即拒絕了。銷毀所有證據(jù)是參謀總長的命令。 回到731以后，石井四郎集合下屬訓(xùn)話：“731部隊(duì)的秘密，要永遠(yuǎn)守口如瓶。如果有誰泄露了軍事秘密，我石井就是追到天涯海角也要將他揪出來！”同時(shí)他向眾人提出3點(diǎn)要求：
1.返回故里也要隱瞞自己曾在731部隊(duì)服役的事實(shí)，掩飾自己的從軍履歷。
2.不得擔(dān)任一切公職。
3.嚴(yán)禁部隊(duì)成員相互聯(lián)絡(luò)。
尤其強(qiáng)調(diào)：“731部隊(duì)的秘密要帶入墳?zāi)?！?/div>
石井之所以下達(dá)封口令，是因?yàn)樗救撕ε鲁蔀閼?zhàn)犯。石井四郎對(duì)731部隊(duì)下達(dá)封口令，其實(shí)也是因?yàn)樗拥搅藚⒅\本部的命令——上層擔(dān)心731部隊(duì)的秘密如讓盟軍發(fā)覺，可能會(huì)危及日本天皇。這項(xiàng)命令早在石井為自己可能會(huì)成為戰(zhàn)犯而惶恐不安之前就下達(dá)了。 二、美日秘密交易 “731”戰(zhàn)犯免于審判
當(dāng)年美國掩蓋了日本細(xì)菌戰(zhàn)犯罪事實(shí)和戰(zhàn)爭責(zé)任，使得以石井四郎為首的731部隊(duì)成員免于戰(zhàn)犯起訴，對(duì)二戰(zhàn)期間飽受日本侵略的人，是極大的不公正、不公平。
研究發(fā)現(xiàn)，1947年5月6日，美軍遠(yuǎn)東司令部向美國國防部發(fā)了一封軍事密電，編號(hào)為52423，電文分成5部分，其中第3部分第2條內(nèi)容為：“3-B，其他包括從石井四郎那里獲得的報(bào)告書等資料，可以通過告知相關(guān)日本人以下消息來獲得，即相關(guān)資料將通過情報(bào)渠道進(jìn)行留存，不會(huì)作為戰(zhàn)爭罪行證據(jù)來使用”。第5部分電文為：“遠(yuǎn)東司令部建議采取3-B所述的方法，請(qǐng)盡快回復(fù)”。
“這是駐日美軍向美國國防部明確提出，為了得到細(xì)菌戰(zhàn)、人體試驗(yàn)等數(shù)據(jù)資料，可以將此前和此后的問訊不作為戰(zhàn)爭罪行證據(jù)，并進(jìn)一步提出了以書面豁免石井四郎及其同伙罪行的方式來獲得?！边@份電文10個(gè)月后得到回復(fù)。1948年3月13日，美國參謀長聯(lián)席會(huì)議給麥克阿瑟下達(dá)了指示：“你所要求的必要信息和科學(xué)數(shù)據(jù)都已悉數(shù)獲得。建議重新提交3-B和第5部分內(nèi)容以便在你需要的時(shí)候進(jìn)行深入斟酌?！?/font>
這份電文說明美國已經(jīng)得到了日本細(xì)菌戰(zhàn)的必要信息和科學(xué)數(shù)據(jù)，“這等同于以豁免石井四郎及731部隊(duì)所有成員為條件，達(dá)到獲取731部隊(duì)全部實(shí)驗(yàn)資料的目的。上述電文可以作為美國同石井四郎秘密交易的最終認(rèn)定文件。”
解密文檔披露了此前不為外界所知的關(guān)于731部隊(duì)的歷史事實(shí)，這是對(duì)日本細(xì)菌戰(zhàn)研究的重要補(bǔ)充，具有回?fù)羧毡痉裾J(rèn)侵華歷史的現(xiàn)實(shí)價(jià)值。當(dāng)年美國掩蓋了日本細(xì)菌戰(zhàn)犯罪事實(shí)和戰(zhàn)爭責(zé)任，使得以石井四郎為首的731部隊(duì)成員免于戰(zhàn)犯起訴，這影響了東京審判的公正性和權(quán)威性，對(duì)二戰(zhàn)期間飽受日本侵略的人，特別是被731部隊(duì)用作人體實(shí)驗(yàn)的中國人、蘇聯(lián)人和朝鮮人及其家屬是極大的不公正、不公平。 附：
 石井四郎（1892年6月25日—1959年10月9日），日本陸軍中將，醫(yī)學(xué)博士，侵華日軍731部隊(duì)首腦。731部隊(duì)的創(chuàng)辦者進(jìn)行許多人體實(shí)驗(yàn)，研制了細(xì)菌武器而知名。在中國等地對(duì)無辜平民進(jìn)行活人細(xì)菌感染、解剖生化實(shí)驗(yàn)，殘忍程度令人發(fā)指，致使不完全統(tǒng)計(jì)約有3000余名中國人、朝鮮人、蘇聯(lián)人、美國人、英國人被活生生的殘害至死，犯下滔天罪行。第二次世界大戰(zhàn)結(jié)束前夕，石井四郎詐死脫過東京軍事法庭的審判，并企圖銷毀所有的罪證。日本戰(zhàn)敗后，他用殘殺萬余人生命代價(jià)獲得的細(xì)菌殺人方法，私下同美國進(jìn)行陰謀交易，逃避了戰(zhàn)爭法庭的審判。 1959年石井四郎患喉癌病逝于老家千葉縣，終年67歲。
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