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重大發(fā)現(xiàn):“冗余密碼子”并非冗余

 大安匠人 2012-04-10

重大發(fā)現(xiàn):“冗余密碼子”并非冗余

破土豆 2012-04-08 11:35:32

64種DNA堿基排列組合形成了生命必須的20種氨基酸。為什么DNA堿基排列組合數(shù)遠遠超出所需呢?它們的存在只是重復和浪費么?

圖中用小西紅柿代表核糖體,試圖展現(xiàn)核糖體作為生命的中心,幫助將遺傳信息翻譯成蛋白質(zhì)的過程。

圖中用小西紅柿代表核糖體,試圖展現(xiàn)核糖體作為生命的中心,幫助將遺傳信息翻譯成蛋白質(zhì)的過程。

地球上所有的生命都通過DNA(對少許的病毒來說,是RNA)來儲存遺傳信息, 并通過DNA表達成蛋白質(zhì)來構成細胞,進而執(zhí)行生命體的種種指令。

遺傳密碼是將DNA翻譯成蛋白質(zhì)的一套特殊指令。DNA由四種分子(又稱為堿基)組成, 通常用A, G, T, C來代表。DNA的編譯是通過將每三個DNA堿基讀取為一個氨基酸, 進而組成蛋白質(zhì)。這種三個連續(xù)的DNA堿基被稱為“密碼子”。

用四種DNA堿基進行排列組合, 密碼子共有4的三次方,即64種不同的排列方式。然而組成蛋白質(zhì)的氨基酸只有20種??茖W家們發(fā)現(xiàn), 不同的密碼子(DNA堿基組合)會被翻譯成同一個氨基酸。例如GCU, GCC, GCA, GCG這四種密碼子都會被翻譯成丙氨酸(Alanine)。科學家們認為這些不同的密碼子將被翻譯成同一種氨基酸,包含的只是重復的信息,而將其稱為“冗余密碼子”。

看到這里, 大概很多人會和我一樣想問這個問題: 這些“冗余”密碼子的作用真的完全相同嗎? 大自然真的會這么低效嗎?

美國加州大學舊金山分校維斯曼(Weissman)研究組的科學家們于2012年3月28日發(fā)表在《自然》(Nature)的一篇 文章 對這個問題給出了部分回答。

維斯曼研究組利用一種新的“核糖體分析”技術來檢測活細胞里的基因活性,包括蛋白質(zhì)合成的速度。他們在檢測細菌中的蛋白質(zhì)合成速度時發(fā)現(xiàn),即便是很輕微的DNA序列的改變都可能對蛋白質(zhì)合成速度產(chǎn)生巨大的影響。他們發(fā)現(xiàn)即使是“沉默突變”(只改變單個DNA堿基但不影響其合成的氨基酸)這樣看似微不足道的變化,也能將蛋白質(zhì)合成的速度減緩到其正常速度的1/10甚至更慢。

這個新發(fā)現(xiàn)向生物學界50余年來的基本“冗余密碼子”假說提出了質(zhì)疑。新發(fā)現(xiàn)可能會大大提高工業(yè)界蛋白質(zhì)的生產(chǎn)效率,有益于生物燃料以及用于治療糖尿病、癌癥等多種常見病所需的生物醫(yī)藥的生產(chǎn)。

維斯曼教授認為,“這些過去被認為是冗余的密碼子顯然并不是單純的重復。 我們雖然還不知道具體的機理,但我們的新研究表明大自然在篩選密碼子的過程中,會在考慮其編譯的氨基酸產(chǎn)物的同時也會考慮其編譯的速度?!?/P>

對編譯速度的選擇,類似于我們給朋友發(fā)短信的時候,有時會寫“NP”而非“No Problem”。雖然他們意思相同,寫“NP”不是打字方便要快一些么?

譯者PS:會不會其實這20種氨基酸也是各自由于其密碼子的不同而有著微小的尚未被發(fā)現(xiàn)的差別呢?

本文編譯自: 加州大學舊金山分校網(wǎng)站3月28日
編譯者: 破土豆
圖片: Gene-Wei Li/UCSF

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