所謂“黑箱”，就是指那些既不能打開(kāi)，又不能從外部直接觀察其內(nèi)部狀態(tài)的系統(tǒng)，比如人們的大腦只能通過(guò)信息的輸入輸出來(lái)確定其結(jié)構(gòu)和參數(shù)。“黑箱方法”從綜合的角度為人們 提供了一條認(rèn)識(shí)事物的重要途徑，尤其對(duì)某些內(nèi)部結(jié)構(gòu)比較復(fù)雜的系統(tǒng)，對(duì)迄今為止人們的力量尚不能分解的系統(tǒng)，黑箱理論提供的研究方法是非常有效的。 　　“黑箱”的研究方法的出發(fā)點(diǎn)在于：自然界中沒(méi)有孤立的事物，任何事物間都是相互聯(lián)系，相互作用的，所以，即使我們不清楚“黑箱”的內(nèi)部結(jié)構(gòu)，僅注意到它對(duì)于信息刺激作出如何的反應(yīng)，注意到它的輸入—輸出關(guān)系，就可對(duì)它作出研究。如果我們能設(shè)計(jì)出一個(gè)系統(tǒng)，在同樣的輸入作用下，它的輸出和所模擬的對(duì)象的輸出相同或相似，就可以確認(rèn)實(shí)現(xiàn)了模擬的目標(biāo)。在此，信息的輸入，就是一個(gè)事物對(duì)黑箱施加影響；信息的輸出，就是黑箱對(duì)其他的事物的反作用。事實(shí)上人們?cè)趯?duì)信息進(jìn)行分析和綜合時(shí)，很少追求結(jié)構(gòu)上的相似性，而總是把握信息的觀點(diǎn)，行為功能的觀點(diǎn)。 　　系統(tǒng)整體優(yōu)化法，即是從系統(tǒng)的觀點(diǎn)出發(fā)，著重從整體與部分之間、整體與外部環(huán)境之間的相互聯(lián)系中，綜合地考察對(duì)象，從而達(dá)到全面地、最佳地解決問(wèn)題的目的。 　　實(shí)踐證明，物質(zhì)具有系統(tǒng)屬性，我們科學(xué)研究的對(duì)象，都可以把它看成是一個(gè)由基本要素組成的動(dòng)態(tài)系統(tǒng)。在這個(gè)系統(tǒng)內(nèi)外，不僅存在著信息傳遞、交換，還有對(duì)信息的處理和控制。同行為功能模擬法一樣，系統(tǒng)整體優(yōu)化法也是信息分析綜合法的一個(gè)重要的發(fā)展和實(shí)用化。在對(duì)任何系統(tǒng)進(jìn)行信息分析和綜合時(shí)，一方面要抓住功能的相似，另一方面則要抓住系統(tǒng)的整體優(yōu)化法，是信息分析綜合法的兩個(gè)實(shí)施法則。只有遵循這兩個(gè)法則，才能作出最優(yōu)的信息分析與綜合。 　　幾千年前的中國(guó)傳統(tǒng)中醫(yī)藥理論是“黑箱”理論的翻版。兩者的科學(xué)結(jié)合將促進(jìn)中國(guó)傳統(tǒng)醫(yī)藥學(xué)的現(xiàn)代化和“黑箱”理論的進(jìn)一步發(fā)展。